上述合作、委托開發技術關系中技術秘密權歸屬的一般原則，依法律規定，均可由當事各方的協議或合同約定加以改變。

(1)委托關系。

如無約定，技術秘密權應歸研究開發人所有，但雙方可事先約定或事后協商，使權利歸雙方共有，或由委托人所有。出現這種協議的原因，在于委托人開發目的需要。一方面，委托人投資開發項目，有相當一部分是想以項目產品占領市場。如果不允許委托人共享或單獨享有技術秘密權，無異于讓委托人出錢，培養自己的競爭對手。另一方面，委托人進行投資，根據合同法第三百三十八條第一款規定，分擔了項目開發不成功的風險。為了鼓勵開發新技術的風險投資，也應允許委托人共享或獨享成果。

委托完成的技術秘密，其所有權是由研究開發人或委托人獨享，還是由雙方共享，最終取決于雙方的談判地位，看誰更需要建立、維持這種委托開發技術的關系。

(2)合作關系。

如無約定，技術秘密權應由合作開發各方共有，也可通過合同約定，進行技術秘密轉讓許可或申請專利時，權利歸其中一方或少數幾方。出現這種個別情況的原因，在于雖同屬合作方，但風險、貢獻有大有小，如果不允許風險、貢獻大的一方或幾方有權進行技術轉讓或申請專利，協作就無法開展。

以上可見，合作、委托關系中的合同、協議不是一個簡單問題，一定要認真對待，以免協議和合同約定對己不利，或由于沒有約定，致使上述法律“一般原則”發生效力，對方又寸步不讓，自己則后悔莫及。