農村水污染，造成如下的危害：一是威脅著農村居民的身體健康。玉林市農村飲用水，大部分是直接采用地表水或淺層地下水，未經任何的處理，水環境的惡化，直接影響農民的身體健康。近年來農村青年兵檢合格率降低，有些村社多年兵檢未有合格者，主要原因是飲用受污染的水。鳳山鎮二中甲肝的暴發便是水源受污染所致。二是生態環境迅速惡化。由于農村水環境污染嚴重，一些河流魚蝦死絕，物種迅速減少。村中臭氣熏天，影響村容村貌，影響招商引資。三是造成農村社會不穩定。由于企業或養殖業污染，造成惡臭熏天，蚊蠅孳生，細菌繁殖，疾病傳播，引起鄰里糾紛，引發新的社會矛盾。群眾生病增多，因病致貧，造成社會不穩。