公安機關在案件偵查終結后，應當將相應的材料移送檢察院，由人民檢察院根據材料進行審核，并且最終做出是否起訴的決定。對于具體案件來說，檢察院審查后，既有可能提起公訴，也有可能做出不起訴決定。

對于檢察院做出不起訴決定的，公安機關處理后續問題一般有以下3點：

1、釋放被不起訴人；人民檢察院作出不起訴決定的，如果被不起訴人在押，公安機關應當立即辦理釋放手續。

2、依法轉為行政案件；人民檢察院提出對被不起訴人給予行政處罰、處分或者沒收其違法所得的檢察意見，移送公安機關處理的，公安機關應當將處理結果及時通知人民檢察院。

3、及時對查扣凍結財物解除措施。應當根據人民檢察院解除查封、扣押、凍結財物的書面通知，及時解除查封、扣押、凍結。

公安機關將案件移送檢察院之后，對于檢察院做出不起訴決定的，應該按照檢察院做出的決定，立即釋放在押的人員，解除對有關涉案財物的查封、扣押、凍結。只有在檢察院明確建議采取行政處理措施的案件移交公安機關處理的，才需要根據檢察院的決定做出相應的行政處理并將結果及時通知檢察院。總而言之，在刑事案件中，行使偵查權的公安機關在行使審查起訴權利的檢察院做出不起訴決定后，必須按照檢察院的決定采取相應的措施。這也是檢察機關對公安機關刑事檢察權的體現！